精神分裂症在初次发病缓解后可有不同的病程变化。大约1/3的病人可获临床痊愈，即不再存有精神病理症状。但即使在这些“康复者”中，由于精神分裂症深刻地影响了患者的正常生活和体验，病人在病愈后也会发现自我感受与过去有所改变。

另一些病人可呈发作性病程，其发作期与间歇期长短不一，复发的次数也不尽相同，复发与社会心理因素有关。与抑郁和躁狂发作有完全缓解不同，精神分裂症的发作与中止无突然的转变与明显的界限。

一些病人在反复发作后可出现人格改变、社会功能下降，临床上呈现为不同程度的残疾状态。残疾状态较轻时，病人尚保留一定的社会适应能力和工作能力。

另有一小部分病人病程为渐进性发展，或每次发作都造成人格的进一步衰退和瓦解。病情的不断加重最终导致患者长期住院或反复入院治疗。

总体上讲，在第一次发作的精神分裂症患者中，有75％可以治愈，约20％可保持终生健康。因此精神分裂症的预后并不像人们所想象的那样悲观。由于现代治疗学的不断进步，大约60％的病人可以达到社会性缓解，即具备一定的社会功能。

对于某一具体的病人，在患病初期确定预后比较困难。有利于预后的一些因素是：起病年龄较晚，急性起病，明显的情感症状，人格正常，病前社交与适应能力良好，病情发作与心因关系密切。通常女性的预后要好于男性。