目前病因尚不明确，大致与下列因素有关：

1．生活事件和人格特征：强迫症与遗传因素、个性特点、不良事件、应激因素等均有关系，尤其与患者的个性特点紧密相关，比如：过分追求完美、犹豫不决、谨小慎微、固执（强迫型人格）等，具备这些不良个性特征容易患强迫症。

2．生化:有不少证据支持强迫症患者有5-HT功能异常。研究表明强迫症患者的神经-内分泌系统功能紊乱，造成神经递质失衡，从而出现各种强迫症状。研究发现强迫症患者体内往往会有5-HT(5-羟色胺)、DA（多巴胺）、 Sigma（西格玛）受体以及中枢谷氨酸能神经元功能障碍，而抗强迫药可使失衡的神经递质趋向正常，从而使强迫症状改善。然而，研究结果的不一致性及作用于强迫症患者5-HT系统的各种药物的效果不一，提示强迫症是一种在病理生理方面具有异源性的一种障碍。多巴胺和胆碱能系统可能也参与了部分强迫症病人的发病。

3．脑病理学:现代脑影像学研究发现，强迫症患者可能存在涉及额叶和基底节的神经回路的异常：基底节存在一个对初始刺激认知和行为释放机制,感觉刺激从感觉器官到皮质，然后到纹状体，如果感觉刺激与纹状体中储存的信息内容相一致，那么就发生对感觉输入的正常反应；然而，如果感觉输入信息起源于前扣带皮质，这部分皮质能在没有适当感觉刺激的情况下引起行为反应，就发生强迫行为。

4．心理学理论:行为主义理论认为强迫症是一种对特定情境的习惯性反应。强迫行为和强迫性仪式动作被认为是减轻焦虑的手段，由于这种动作仅能暂时的减轻焦虑，从而导致了重复的仪式行为的发生。