患有原发性焦虑障碍，如广泛性焦虑症（GAD）、惊恐障碍、恐惧症以及创伤后应激障碍(post-traumatic stress disorder，PTSD)的患者，在这些患者中，某些医学疾病的发病率要高于一般人群。事实上焦虑障碍与相当数量医疗疾病发病率的增加有关，尤其是以下7类疾病。

焦虑症与心血管疾病发病率增加，恐慌频繁发作和心脏转归恶化有密切关系。PTSD也容易导致心血管疾病风险增加，再住院率上升以及治疗方案依从性的降低。长期临床经验有如下总结：心脏疾病如心绞痛，心律失常，心脏压塞，充血性心力衰竭（左侧），心肌梗塞或心脏瓣膜疾病都可能表现出焦虑症状。

焦虑可以导致交感神经过度激活并影响下丘脑-垂体-肾上腺轴，进而影响整个神经内分泌系统，增加健康风险。容易表现出焦虑的神经内分泌系统疾病包括库欣病（垂体ACTH腺瘤或ACTH细胞增生，分泌过多ACTH，引起肾上腺皮质增生，产生皮质醇增多症，导致一系列物质代谢紊乱和病理变化，临床上表现为库欣综合征），糖尿病，副甲状腺疾病（甲状旁腺功能亢进，假性甲状旁腺功能亢进），胰腺肿瘤，肾上腺嗜铬细胞瘤，垂体疾病和甲状腺疾病（甲状腺功能亢进，甲状腺功能减退，甲状腺炎）。

患有原发性焦虑障碍的患者更可能罹患胃肠道疾病、呼吸道疾病、心血管疾病和神经内分泌系统疾病，尤其是这些患者可能还伴有性功能障碍、抑郁症和物质使用障碍等混杂因素。有研究表明，在惊恐障碍、GAD和PTSD患者中，肠易激综合征的发生率远高于无精神障碍诊断的患者。容易表现焦虑的胃肠道疾病可能包括胃食道逆流性疾病，肠易激综合征和消化性溃疡疾病等。

焦虑可能会导致体内炎症反应的变化，结节性多动脉炎、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、颞动脉炎和其他炎性病症都可能表现出焦虑症状。

可能表现为焦虑症的代谢疾病包括高钾血症，高热，低血糖症，低血钠症，低氧血症，卟啉症或物质摄入/过量。在生物学上，急性焦虑症可能是潜在性疾病恶化、未确诊的医疗病症、物质中毒或物质戒断的首要迹象。如果患者突患急性焦虑症，临床上除对焦虑症状（精神症状）进行对症治疗以外，还需要进一步的身体检查，包括详细的病史、药物史、重点体检、间接信息以及诊断测试如毒理学筛查等，排除或进一步确诊潜在性身体疾病的可能。

原发性焦虑症，特别是恐慌症，可能会伴有癫痫发作。帕金森患者经常会出现社会焦虑症和惊恐发作。其他